我校2008年以来进一步健全完善科学规范的领导管理体制、运行机制和决策机制，目前学校已经建立了行之有效的“校、院、系三级建制和校、院两级管理”的管理架构。在校级层面，形成了“五位一体”的民主管理体制和“四会并举”的科学决策体制，现运转良好。
        一、“五位一体”的领导管理体制
        学校以党委领导下的校长负责制为根本，构建起校党委领导、校长负责、教授治学、民主管理和社会参与“五位一体”、民主科学、规范高效的领导与管理体制。
        党委领导是根本。 党委会及其常委会是学校的决策机构。学校党委统一领导学校工作，对学校所有重大事项进行决策、实施领导，保证学校办学方向，保证党和国家对学校的领导与政策落实，保证学校事业不断发展。党委决策以民主集中制为基本原则，坚持集体领导和个人分工负责相结合的制度，按照“谁主管、谁牵头、谁负责”的原则，常委根据分工和集体决策履行职责。
        校长负责是关键。在学校党委领导下，校长全面履行《高等教育法》所赋予的规划计划、行政管理、学术管理等有关职权，对学校行政事务、业务发展实施管理，对具体办学负总责，组织完成改革、建设、发展的全面工作任务。校长负责的基本组织形式为校长办公会。
        教授治学注重学术。学校设立了学术委员会、教育教学委员会、聘任委员会、学位委员会等学术组织，发挥以教授为核心的师生员工在办学中的主导与骨干作用，倡导学术民主氛围、保证学术道德要求、推动学术交流活动，提高学术水平。
        民主管理倡导参与。学校有效实施教职工代表大会制度和校务公开制度。教职工代表大会定期召开会议，全面参与学校管理，成为校党委和校长全心全意依靠教职工办学的核心渠道，体现了全心全意依靠教职工民主办学的理念。学校积极推进校务、党务、信息公开工作，采取网络、会议、公开栏、绿色通道等多种形式实现“能公开即公开”。
        校委会整合资源提供支持。学校于2008年5月成立了首都医科大学校务委员会，由上级领导部门、校本部和临床的干部、资深教授代表、院士和知名专家、地方和学生家长代表组成。校委会积极整合社会力量，为学校决策提供咨询参考，为学校建设发展提供智力和资源支持。
        二、“四会并举”的科学决策体制
        学校不断完善党委会及其常委会、校长办公会和书记校长联席会相关工作规则和制度建设，形成“四会”各司其职、各尽其责，良性互动、协同发展的学校科学决策体制，使学校决策更加规范、民主、科学、高效。
        完善党委全委会决策程序与运行机制。校党委修订了《首都医科大学校党委全委会议事规则》，进一步完善了决策程序与运行机制，并严格执行。2008年至今，召开全委会12次，审议重大议题36个。
        完善党委常委会决策程序与运行机制。在全委会闭会期间，党委常委会行使党委会职权，承担领导与决策责任，对全委会负责。校党委修订了《首都医科大学校党委常委会议事规则》，进一步完善了党委常委会决策程序与运行机制，并严格执行。2008年至今，召开常委会201次，审议议题842个。
        完善校长办公会决策程序与运行机制。校长办公会议是学校党委领导下校长负责制的集体领导组织形式，是实行学校法人治理的主要组织形式，是学校行政事务决定与执行机构。校党委修订《首都医科大学校长办公会议事规则》，进一步完善了校长办公会的决策程序与运行机制，并严格执行。2008年至2011年底，召开校长办公会169次，审议议题1171个。
        坚持制度化的沟通机制——书记校长联席会。书记校长联席会是学校领导班子集体沟通协调的会议，是党政沟通的制度化平台。原则上一周召开一次，由校党委书记或校长召集并主持。党委书记、校长、副书记、副校长、校长助理、秘书长、教务长、财务长、总务长、学校办公室主任或副主任参加。对于实现决策的规范化、科学化，沟通机制至关重要。
        问渠那得清如许，为有源头活水。立足于制度完善和管理创新，经过几年持续不懈的努力，首都医科大学形成了比较科学民主、规范高效的管理与决策体系，有力地保障了学校更新更好更快地发展，不断推动学校向着创建“国内一流国际知名”医科大学的宏伟目标迈进。