我校江涛教授团队联合中国科学院生物物理所陈润生院士团队于今年5月在Clinical Cancer Research（IF：8.738）上发表论文，题目为“The Landscape of Viral Expression Reveals Clinically Relevant Viruses with Potential Capability of Promoting Malignancy in Lower-Grade Glioma”。该研究通过RNA测序方法，发现了脑胶质瘤的预后和病毒感染有关，并证实了相关病毒的存在。

　　近年来，RNA测序（RNA-seq）被证明是有效的揭示病毒-肿瘤关系的新方法。为了探究病毒与胶质瘤之间的相关性，该研究对中国胶质瘤基因组图谱项目（CGGA）的325例mRNA测序数据进行了细致的分析。首先，筛选出不能比对到人基因组的序列，并尝试将这些序列比对到病毒基因组，筛选潜在的病毒来源的转录本。然后，根据基因组大小和测序深度来定量计算（VPKM）每个转录本的表达量，通过聚类分析，发现大部分病毒基因倾向于在某些特定患者中表达。为获得更多发现，研究团队以感染与否为分组依据，对患者进行生存分析后，发现感染了猿猴病毒40（SV40）或羊猴肉瘤病毒（WMSV）的患者比未感染的患者有着更短的总生存期。为更好的评价病毒和临床预后的关系，研究团队应用多变量Cox比例风险模型来评估SV40和WMSV的预后价值，发现在低级别胶质瘤中，无论SV40还是WMSV，都是预测患者生存的独立预后因素。随后的基因分析表明，SV40与调控基因表达的负调控相关，而WMSV与肿瘤细胞的频繁增殖和细胞周期有关。

　　该研究证实，脑胶质瘤的预后和是否有病毒感染有密切关系，SV40和WMSV两种病毒可作为低级别胶质瘤的预后标志物，为脑胶质瘤的靶向治疗提供了有力的分子依据。

　　该研究获得国家重点研发计划“精准医学专项”、首都卫生发展科研专项等项目的资助。（撰稿：王政　审校：江涛）

全文链接：The Landscape of Viral Expression Reveals Clinically Relevant Viruses with Potential Capability of Promoting Malignancy in Lower-Grade Glioma. Clin Cancer Res. 2017 May 1;23(9):2177-2185. doi: 10.1158/1078-0432.CCR-16-1495. Epub 2016 Nov 18.