江涛教授团队在Clinical Cancer Research发文阐述脑胶质瘤细胞纯度的临床、基因组学与生物学意义
北京市神经外科研究所江涛教授团队联合中国医科大学第一附属医院吴安华教授团队于2017年10月在Clinical Cancer Research(IF:9.619)上发表论文,题目为“Tumor Purity as an Underlying Key Factor in Glioma”。该研究通过整合5个数据库、2249例脑胶质瘤组织样本的基因表达谱数据及对应的临床、基因拷贝数、基因突变等多维组学数据,分析了脑胶质瘤细胞纯度的临床、基因组学与生物学意义,这是国际上目前最大规模的脑胶质瘤细胞纯度分析研究。
脑胶质瘤组织中既包含肿瘤细胞,又包含间质细胞、免疫细胞等非肿瘤细胞。既往研究认为,组织中的肿瘤细胞是恶性表型的主要原因,而越来越多的证据表明,肿瘤微环境中的间质细胞、免疫细胞可促进肿瘤的增殖、侵袭与血管生成等生物学功能,但目前的脑胶质瘤分型系统并未考虑这一问题。该研究通过应用ESTIMATE算法,获得了基于基因表达谱的脑胶质瘤样本肿瘤细胞纯度(肿瘤细胞百分比)。通过整合分析样本的临床信息,发现纯度较低的肿瘤恶性程度更高(WHO级别更高),预后也更差。通过整合分析样本的基因组学信息,发现不同纯度的样本也具有特征性的基因组学变化。低纯度的肿瘤多具有7号染色体扩增与10号染色体缺失,而高纯度的肿瘤多具有染色体1p19q共缺失。另外,通过表达谱数据的整合分析与免疫组化验证,发现低纯度肿瘤具有更多的免疫细胞浸润,显著高表达巨噬细胞、小胶质细胞和中性粒细胞的表达特征,表现出了更强的免疫表型。
综上所述,该研究发现脑胶质瘤细胞及肿瘤微环境中的间质细胞、免疫细胞与肿瘤的临床、基因组学及生物学特征具有显著相关,提示了肿瘤细胞纯度在脑胶质瘤诊疗过程中的重要价值,为免疫治疗的开展及疗效评估提供重要参考。